El Fòrum Empresarial del Llobregat està gestionat pels següents òrgans:
Consell Executiu: Junta integrada per un president i 15 socis, que definiran les línies d’actuació, i de la qual dependrà l’Oficina del Fòrum, que gestionarà la secretaria, les relacions institucionals, la comunicació i l’organització de les activitats.
Consell Assessor: Integrat per col·laboradors externs, que identificaran les línies d’orientació.
Consell General: Integrat per la totalitat dels socis.
Els socis s'organitzaran en cinc Comissions de Treball:

Comissió d’Infraestructures

Comissió d’Indicadors Econòmics

Comissió de Gestió del Canvi

Comissió de Relacions Institucionals

Comissió d’Activitats